În anul academic 2011/2012, Facultatea de Medicină Veterinară îşi desfăşoară activitatea didactică şi de cercetare ştiinţifică structurată În 4 departamente. Fiecare departament este condusă de un director de departament, după cum urmează: 

Departamentul I: Învăţământ preclinic

Departamentul II: Învăţământ clinic I

Departamentul III: Învăţământ clinic II

Departamentul IV: Producţii animale şi sănătate publică veterinară